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  1. 基因测序的步骤是什么?
  2. 人类全基因组测序
  3. 宏基因组测序流程
  4. 人类基因组计划的内容是什么?
  5. 基因组测序有哪些策略

1、基因测序的步骤是什么?

首先准备基因组,然后将DNA随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头。

利用trim_galore软件对原始数据进行去除接头序列及低质量碱基等质控步骤。 (二)序列比对 经过质控的reads需要根据与参考基因组的序列相似度比对到参考基因组上。

然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇,然后再进行新一条链的合成,在此合成过程中边合成边测序,没加上去一个碱基,机器就读一次,根据其发到荧光来判断加的是那种碱基,这样就能得到所要的序列信息了。

整个测定的程序如下:(1)将被测DNA制成单链模板。分别加入4个反应管中。并在每个管中加入引物、DNA聚合酶和4种dNTP(其中一种为32P标记)。(2)在4个管中分别加人ddTTP、ddCTP、ddGTP和ddATP,保温。

2、人类全基因组测序

问题一:个人全基因组重测序需花费多少钱? 人类基因组大小3G, 重测序一般需要测定至少20x以上的数据(数据乘数高的话对于信息分析是有海的),也就是说一般需要测定60G的数据,如果1G按照5000元算的话,需要30万元。

人类基因组测序意义如下:能够有效反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图,从而推动基因新技术发展,促进人类健康。完善人类基因组研究涉及的伦理、法律和社会问题,维护社会稳定。

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。全基因组预测的意义揭示了人类生、老、病和死的奥秘,使人类从根本上认知疾病发生的原因,做到正确的治疗疾病和尽早的预防疾病。

全基因组测序,就是检测出全部30亿个碱基对是怎么排列的,从第一个到第30亿个,一个都不落下。它是检测人类所有基因组信息,不针对任何单个疾病或者因素的基因,但又囊括了之前所有单个基因检测要用到的信息。

问题一:全基因组测序的技术路线 提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行基因簇cluster制备或电子扩增E-PCR,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。

3、宏基因组测序流程

二代测序适合扩增子测序(例如16S、18S、ITS的可变区),而基因组、宏基因组DNA则需要使用鸟枪法(Shotgun method)打断成小片段,测序完毕后再使用生物信息学方法进行拼接。

宏基因组测序则是将微生物基因组DNA随机打断成500bp的小片段,然后在片段两端加入通用引物进行PCR扩增测序,再通过组装的方式,将小片段拼接成较长的序列。16S测序主要研究群落的物种组成、物种间的进化关系以及群落的多样性。

宏基因组测序原理将基因组DNA随机打断成若干条500bp的小片段(类似于拼图中的单个形状不一的模块),然后连接接头(双端120bp),在片段两端加通用引物进行PCR扩增测序。

宏基因组分箱(Binning)是将宏基因组测序得到的混合了不同生物的序列或序列组装得到的contigs按物种分开归类的过程。

4、人类基因组计划的内容是什么?

所以人类基因组就是作图,或者狭义的人类基因组计划,就是作图的计划,遗传图、物理图、序列图,然后基因图。 在人类基因组计划进行大规模测序的策略有两种,一种就是我刚才说的那种思路,实际上叫逐个克隆。

HGP的主要任务是人类的DNA测序,遗传图谱、物理图谱、序列图谱 、基因图谱,此外还有测序技术、人类基因组序列变异、功能基因组技术、比较基因组学、社会、法律、伦理研究、生物信息学和计算生物学、教育培训等目的。

国际人类基因组计划是人类首次全面、系统地研究人类遗传物质DNA的一项国际合作公益计划。它的核心内容是,测定人类基因组的全部DNA序列,从而获得人类最基本的生物学信息,成果将由全人类自由分享,是21世纪生命科学的基础和先导。

人类基因线计划是对人体的30亿对核苷酸全序列进行作图、基因定位并对主要基因功能进行分析,为全面认识和了解人类基因组的结构和功能提供详尽的基础资料。这一计划的完成标志着后基因组学时代的到来。

后基因组计划就是人类完成人类基因组计划(结构基因组学)以后的若干领域,实际上是指完成顺序后的进一步计划,其实质内容就是生物信息学与功能基因组学。

5、基因组测序有哪些策略

大规模测序基本策略 逐个克隆法:对连续克隆系中排定的BAC克隆逐个进行亚克隆测序并进行组装(公共领域测序计划)。

③测序策略:有参选择WGS,无参选择简化基因组,测序数据量10x,如果样本数量很多500个样本以上,测5x即可。

在人类基因组测序起步的时候,当时用的DNA序列的分析方法是凝胶电泳为主的方法,基本上还是手工运作的。但是在20世纪90年代以后,新的一个测序技术产生了就是毛细管电泳仪技术。使得测序的速度大大加快。

许多经济作物的测序正在计划或进行中。这些基因组的特点是多倍体、重复序列多、基因组为数g至数十g。三代测序用于人类的DNA甲基化修饰也正在研究中。

测定组成人类染色体的30亿个碱基对的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,并辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。

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